La orden de Malta Colombia cuenta con dos Centros Comunitarios:
El Centro Nuestra Sra. de Filermo, ubicado en Palermo Sur en la localidad Rafael Uribe debe su nombre a la patrona de los miembros de la Orden.
Tiene como misión el apoyo a la comunidad a través de servicios que contribuyan a su salud integral. Abre sus puertas de lunes a sábado y ofrece sin costo alguno servicios de enfermería, psicología ,trabajo social, capacitación, formación y actividades para ocupación de tiempo libre.
Recibe cerca de 450 personas al mes.
Este trabajo se desarrolla en alianza con Javesalud y la Fundación Chaminade.
El Centro Comunitario en Lisboa, ubicado en Suba cuenta con servicios para toda la comunidad enfocandose especialmente en el apoyo a las personas en condición de discapacidad y población de tercera edad.
Mensualmente el centro dona Mercados de Francisco para 70 familias y pañales a entre 90 y 100 personas de manera permanente.
El Centro presta sus servicios en alianza con la parroquia Beato Juan Bautista Scalabrini.